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결석을 형성하는 위험 인자들은 많이 있습니다. 이들 중에는 결석의 가족력이나 신장 구조의 이상 그리고 하루에 섭취하는 수분의 함량 등이 있습니다. 어떤 결석들은 유전적인 요인이나 통풍, 식이의 장애, 장 질환과 같은 다른 질환에 의해 생길 수 있습니다.

결석 발생의 원인은 대사장애 검사를 통하여 75% 이상에서 밝혀집니다. 이 검사에는 결석 성분 검사, 혈액검사, 24시간 소변검사 등이 포함됩니다. 만약 결석 발생의 원인이 밝혀지면 적절한 치료를 통하여 결석 재발율을 50%에서 10%로 낮출 수 있습니다.
결석 발생의 흔한 원인들로는 수분 섭취가 적거나 또는 결정체를 만들 수 있는 소변 내 물질의 흡수, 생성 및 제거의 장애를 들 수 있습니다. 이러한 위험 인자들을 밝혀 원인에 따른 적절한 식이요법과 약물치료를 한다면 결석의 재발율을 낮출 수 있습니다.